גיאוגרפיה
קבוצת איי גלפגוס ממוקמת כ – 1000 ק"מ מחופי אקוודור, בין קווי רוחב 0-1 מעלות דרומה לקו המשווה (89-92 מעלות מערב). היא כוללת 13 איים עיקריים, 6 איים קטנים ועוד למעלה מ– 40 איונים נוספים. שטחם הכולל של האיים 8009 קמ"ר (מהם 4600 קמ"ר באי איזבלה לבדו). שטח המרחב הימי הכולל של השמורה 45,000 קמ"ר. 
שמות
השם גלפגוס ניתן ככל הנראה עקב הדמיון של שריון הצבים ממין מסוים לאוכף סוס. מספרדית: אוכף = Galapagoe. שמות נוספים: 'איי דארווין' או 'ארכיפלג אקוודור' Archipelago del Ecuador. ב– 1892, לרגל ציון 400 שנה לגילוי אמריקה ע"י קולומבוס נקראו האיים 'ארכיפלג קולומבוס' Archipelago de Colon וב – 1535 נקראו האיים Islas encantadas – 'האיים המכושפים', עקב הסערה שגרמה חזיונות של איים מופיעים ונעלמים במסעו של ברלנגה.
לאיים עצמם ניתנו במהלך ההיסטוריה שמות רבים, ע"י הפירטים האנגלים (ע"ש בכירי אצולה בריטיים), ע"י הספרדים, ע"י ציים שונים שעברו במקום (ארה"ב, ספרד, אנגליה) וכמובן - ע"י ממשלת אקוודור. כך קיימים לכל אי כמה שמות, לעיתים עד שמונה שמות לאותו אי. 
היסטוריה
ההיסטוריה המודרנית מתחילה בשנת 1535 עם גילוי האיים ע"י בישוף פנמה פריי תומס דה-ברלנגה, שסטה מנתיבו מפנמה לפרו. עם זאת, קרוב לוודאי שהראשונים שדרכו על אדמת האיים היו אינדיאנים מדרום אמריקה.
בסוף המאה ה– 16 הפכו פיראטים את האיים למרכז פעילות שסיפק להם מים, מקלט ומזון ובהמשך פקדו גם ציידי לווייתנים ואריות ים איים שונים. ב- 12.2.1832 תפשה אקוודור חזקה על האיים באופן רשמי ע"י הקולונל איגנסיו הרננדז וב- 14.5.1936 הוכרזו כל האיים כפארק הלאומי הראשון של אקוודור.
גיאולוגיה
מבחינה גיאולוגית, האיים הם פסגותיו של רכס וולקני, העולה מקרקעית האוקיאנוס וכולם נוצרו בהתפרצויות חוזרות ונשנות של לבה וטוף. ב– 200 השנים האחרונות אירעו יותר מ– 50 התפרצויות (מהן חמש ב- 15 השנים האחרונות). רבים מן האיים הנם תלים געשיים שעליהם נמנו כ- 2000 לועות, שאחדים מהם עדיין פעילים ומעלים קיטור. ע"י חקירת גיל הבזלת נמצא שגיל האיים 5 מיליון שנה, אך יש ביניהם צעירים ובוגרים: המערביים צעירים בהרבה מהאיים המזרחיים וגילם רק כמיליון שנה. האיים עדיין מתפתחים: לדוגמא, בשנת 1954 התחמם כל קו החוף של מפרץ Urvina באי איזבלה באורך של כ – 6 ק"מ ב- 5 מטר ! ב – 68' קרסה הקלדרה (הלוע) של האי פרננדינה ובתוך שבועיים נעלמו כ – 300 מטרים. 
טבע
באיים מוכרים כיום כ– 600 מיני חי וצומח, לעומת כ– 20,000 מינים באקוודור. אלה כוללים כ– 400 מיני דגים, כמאה מיני ציפורים, 22 מיני זוחלים (כמעט כולם אנדמיים), וכמה מיני יונקים – כולם עטלפים. כשליש ממיני הצומח אנדמיים, וכן כחמישית ממיני הדגים ויותר מ– 80% מהמינים היבשתיים.